系综
系综一词在热力学上用来描述体系所处的热力学状态。字母代表守恒量
粒子数 (Number)、体积(Volumn)、压力(Pressure)、能量(Energy)、温度(Temperature)、焓(Enthalpy)、化学势 (μ)
NVT:正则系综,比如用于固定体积采样
NPT:等温等压系综。液态体系模拟一般都用此系综,比如用于获得合理密度
- NVE:微正则系综。用于考察绝热、能量守恒过程,比如用于检验能量守恒
- μVE:巨正则系综。适合描述开放体系
- NPH:等焓等压系综
- NPγT:压力/表面张力/温度、比如用于膜和界面
常见流程:Energy minimization → NVT → NPT → Production MD
- EM消除原子重叠、溶剂插入过近和异常高能接触
- NVT稳定温度,常配合位置限制
- NPT释放盒子体积,使密度和压力趋于合理
- 生产模拟前应检查温度、压力、密度、势能和结构稳定性